HEKS leistet Überlebens- und Nothilfe und bekämpft die Ursachen von Hunger, Ungerechtigkeit und sozialem Elend. Alle Menschen sollen ein würdiges und in sozialer, wirtschaftlicher und politischer Hinsicht sicheres Leben führen können.

HEKS ist das Hilfswerk der Evangelischen Kirchen Schweiz mit Hauptsitz in Zürich und einer Geschäftsstelle für die französische Schweiz in Lausanne. Die französische Bezeichnung lautet EPER (Entraide Protestante Suisse). HEKS wurde 1946 vom Schweizerischen Evangelischen Kirchenbund (SEK) gegründet und ist seit 2004 als Stiftung organisiert. Der Stiftungsrat ist das oberste Organ der Stiftung. Er besteht aus sechs bis neun Personen, wovon eine Person durch den Rat SEK und die restlichen Personen durch die Abgeordnetenversammlung SEK gewählt werden. Die Amtsdauer eines Stiftungsrates oder einer Stiftungsrätin beträgt vier Jahre.

Entwicklung ländlicher Gemeinschaften
Friedensförderung und Konfliktbewältigung
Soziale Integration
Anwaltschaft für sozial Benachteiligte
Humanitäre Hilfe
Kirchliche Zusammenarbeit